厚労省結核感染症課に教えていただきました(ご多忙のところ、ありがとうございます)。転載フリーです。被災地から「疎開」してもHIV診療など感染症診療は別の医療機関でも公的補助(自立支援医療など)を受けながら可能だそうです。
http://www.mhlw.go.jp/stf/houdou/2r98520000014tr1-img/2r985200000156kq.pdf
神戸大学病院感染症内科でももちろん、HIV感染者、その他の感染症などの診療を兵庫県内外の方に対して提供できます。外来は月曜日から金曜日まで毎日、緊急時は夜間、週末も対応します。
http://www.med.kobe-u.ac.jp/ke2bai/contents/shinryo/index.html
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